Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cops9Q3U898 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms