Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms