Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy4Q3TYX8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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