Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms