Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntnap5cQ0V8T7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms