Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms