Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms