Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms