Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GscQ02591 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GscQ02591 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GscQ02591 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms