Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nme2Q01768 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms