Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms