Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms