Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms