Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F8a1Q00558 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F8a1Q00558 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms