Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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