Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crnkl1P63154 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms