Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp46P62069 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp46P62069 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms