Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P58686 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P58686 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P58686 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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