Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp25P57080 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp25P57080 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms