Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GferP56213 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
GferP56213 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
GferP56213 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms