Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Efnb1P52795 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms