Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VdrP48281 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VdrP48281 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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