Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms