Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf1P39428 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms