Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms