Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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