Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RarbP22605 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RarbP22605 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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