Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms