Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VimP20152 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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