Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cxcl2P10889 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms