Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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