Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms