Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms