Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms