Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kpna3O35344 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kpna3O35344 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kpna3O35344 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms