Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NumblO08919 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NumblO08919 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NumblO08919 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NumblO08919 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms