Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MttpO08601 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms