Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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