Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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