Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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