Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms