Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21746J3QMM6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21746J3QMM6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21746J3QMM6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21746J3QMM6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms