Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BC067074F6RXI4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms