Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gm20518E9Q548 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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