Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms