Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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