Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC048679D3YXE9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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