Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef20B1ARV6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef20B1ARV6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms