Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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