Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbp4A4UUI3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbp4A4UUI3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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